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Enregistrement W2902294516 · doi:10.1021/acs.jproteome.8b00885

Toward Completion of the Human Proteome Parts List: Progress Uncovering Proteins That Are Missing or Have Unknown Function and Developing Analytical Methods

2018· editorial· en· W2902294516 sur OpenAlexafffund
Young‐Ki Paik, Christopher M. Overall, Fernando J. Corrales, Eric W. Deutsch, Lydie Lane, Gilbert S. Omenn

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2018
Typeeditorial
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute of Environmental Health SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésProteomeLibrary scienceFunction (biology)MedicineWorld Wide WebBioinformaticsBiologyComputer scienceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ADVERTISEMENT RETURN TO ISSUEEditorialNEXTToward Completion of the Human Proteome Parts List: Progress Uncovering Proteins That Are Missing or Have Unknown Function and Developing Analytical MethodsYoung-Ki Paik*Young-Ki PaikYonsei Proteome Research Center, College of Life Science and Technology, Yonsei University*Y.-K.P.: E-mail: [email protected]More by Young-Ki Paikhttp://orcid.org/0000-0002-8146-1751, Christopher M. OverallChristopher M. OverallCentre for Blood Research, Departments of Oral Biological & Medical Sciences and Biochemistry & Molecular Biology, Faculty of Dentistry, University of British ColumbiaMore by Christopher M. Overallhttp://orcid.org/0000-0001-5844-2731, Fernando CorralesFernando CorralesFunctional Proteomics Laboratory National Center of Biotechnology, CSICMore by Fernando Corrales, Eric W. DeutschEric W. DeutschInstitute for Systems BiologyMore by Eric W. Deutschhttp://orcid.org/0000-0001-8732-0928, Lydie LaneLydie LaneCALIPHO Group, SIB Swiss Institute of Bioinformatics and Department of Microbiology and Molecular Medicine, Faculty of Medicine, CMU, University of GenevaMore by Lydie Lanehttp://orcid.org/0000-0002-9818-3030, and Gilbert S. Omenn*Gilbert S. OmennInstitute for Systems Biology, Departments of Computational Medicine & Bioinformatics, Internal Medicine, and Human Genetics & School of Public Health, University of Michigan*G.S.O.: E-mail: [email protected]More by Gilbert S. Omennhttp://orcid.org/0000-0002-8976-6074Cite this: J. Proteome Res. 2018, 17, 12, 4023–4030Publication Date (Web):December 7, 2018Publication History Published online7 December 2018Published inissue 7 December 2018https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jproteome.8b00885https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.8b00885editorialACS PublicationsCopyright © 2018 American Chemical Society. This publication is licensed under these Terms of Use. Request reuse permissions This publication is Open Access under the license indicated. Learn MoreACS Editors' Choice® is a collection designed to feature scientific articles of broad public interest. Read the latest articlesArticle Views2134Altmetric-Citations19LEARN ABOUT THESE METRICSArticle Views are the COUNTER-compliant sum of full text article downloads since November 2008 (both PDF and HTML) across all institutions and individuals. These metrics are regularly updated to reflect usage leading up to the last few days.Citations are the number of other articles citing this article, calculated by Crossref and updated daily. Find more information about Crossref citation counts.The Altmetric Attention Score is a quantitative measure of the attention that a research article has received online. Clicking on the donut icon will load a page at altmetric.com with additional details about the score and the social media presence for the given article. Find more information on the Altmetric Attention Score and how the score is calculated. Share Add toView InAdd Full Text with ReferenceAdd Description ExportRISCitationCitation and abstractCitation and referencesMore Options Share onFacebookTwitterWechatLinked InRedditEmail PDF (806 KB) Get e-AlertscloseSUBJECTS:Genetics,Peptide identification,Peptides and proteins,Protein identification,Proteomics Get e-Alerts

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,362
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,185
Tête enseignante GPT0,477
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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