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Enregistrement W2902484528 · doi:10.1093/ofid/ofy210.2054

2401. Risk Factors for Antimicrobial Resistance in Invasive Pneumococcal disease (IPD) in Toronto, Canada, 2012–2017

2018· article· en· W2902484528 sur OpenAlexaffabout
Thomas Fear, Karen Green, Agron Plevneshi, Jeff Li, Wallis Rudnick, Sarah Nayani, Allison McGeer

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensSinai Health SystemMount Sinai HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineLevofloxacinPenicillinAntimicrobial stewardshipMeningitisInternal medicineOdds ratioAntimicrobialStreptococcus pneumoniaeAntibiotic resistanceBroth microdilutionPediatricsAntibioticsMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Several studies have documented factors predictive of antimicrobial resistance (AMR) in invasive pneumococcal disease(IPD). However, the implementation of routine pediatric PCV programs, antimicrobial stewardship, and increasing immunocompromised in populating might be expected to change such factors. We report on predictive factors for AMR in IPD from 2012 to 2017. TIBDN performs population-based surveillance for IPD in Toronto/Peel (pop 4.5M). IPD cases are reported to a central office and one isolate/case is serotyped and has antimicrobial susceptibility testing performed by broth microdilution to CLSI standards. 2459 cases of IPD were identified from January 2012 to December 2017. Overall rates of resistance to penicillin, macrolides, fluoroquinolones, and TMP-SMX were relatively stable over the course were stable over the study. Risk factors for infection with resistant to penicillin at meningitis breakpoints as opposed to penicillin- susceptible pneumococci were current residence at nursing home (odds ratio [OR], 2.30; P < 0.001), immune compromised status (OR, 1.41; P = 0.012), HIV infection (OR 2.13, P = 0.016), history of receiving PPV23 vaccine (OR 1.38; P = 0.007). Infection with TMP-SMX-resistant pneumococci was associated with HIV infection (OR, 3.2; P = 0.001) and current residence in a nursing home (OR 2.4, P = 0.002). Infection with macrolide-resistant isolates was associated with any use of macrolide 3 months prior to infection (OR, 3.24; P < 0.001), or macrolide treatment failure of the current episode (OR, 6.64; P = 0.003). Infection with levofloxacin-resistant pneumococci was associated with current residence in a nursing home (OR, 13.7; P < .001), and fluorquinolone treatment failure of the current episode (OR 49.4, P = 0.0034). Previous same class antibiotic exposure remains a major predictive factor for macrolide resistance. History of treatment failure is a predictive factor for macrolide and fluoroquinolone failure. HIV infection and immune compromise are risk factors for IPD infection with penicillin resistant pneumococci. Hospital acquisition of infection is no longer a risk factor for fluoroquinolone resistance. All authors: No reported disclosures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,194

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
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