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Enregistrement W2902514831 · doi:10.1186/s12870-018-1528-6

Identification and characterization of drought-responsive CC-type glutaredoxins from cassava cultivars reveals their involvement in ABA signalling

2018· article· en· W2902514831 sur OpenAlexfundno aff
Mengbin Ruan, Yiling Yang, Kaimian Li, Xin Guo, Bin Wang, Xiaoling Yu, Ming Peng

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRedox biology and oxidative stress
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsCentral Public-interest Scientific Institution Basal Research Fund for Chinese Academy of Tropical Agricultural SciencesInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of Tropical Agricultural SciencesChinese Academy of Sciences
Mots-clésGlutaredoxinBiologyArabidopsisGenomeTranscription factorAbscisic acidAbiotic stressBotanyAbiotic componentBiotic stressGeneCell biologyGeneticsMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: CC-type glutaredoxins (GRXs) are plant-specific glutaredoxin, play regulatory roles in response of biotic and abiotic stress. However, it is not clear whether the CC-type GRXs are involve in drought response in cassava (Manihot esculenta), an important tropical tuber root crop. RESULTS: Herein, genome-wide analysis identified 18 CC-type GRXs in the cassava genome, of which six (namely MeGRXC3, C4, C7, C14, C15, and C18) were induced by drought stress in leaves of two cassava cultivars Argentina 7 (Arg7) and South China 124 (SC124). Exogenous abscisic acid (ABA) application induced the expression of all the six CC-type GRXs in leaves of both Arg7 and SC124 plants. Overexpression of MeGRXC15 in Arabidopsis (Col-0) increases tolerance of ABA on the sealed agar plates, but results in drought hypersensitivity in soil-grown plants. The results of microarray assays show that MeGRXC15 overexpression affected the expression of a set of transcription factors which involve in stress response, ABA, and JA/ET signalling pathway. The results of protein interaction analysis show that MeGRXC15 can interact with TGA5 from Arabidopsis and MeTGA074 from cassava. CONCLUSIONS: CC-type glutaredoxins play regulatory roles in cassava response to drought possibly through ABA signalling pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,095
Score d'incertitude au seuil0,490

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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