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Enregistrement W2902710416 · doi:10.1016/j.ajhg.2018.10.024

DNA Polymerase Epsilon Deficiency Causes IMAGe Syndrome with Variable Immunodeficiency

2018· article· en· W2902710416 sur OpenAlexaff
Clare V. Logan, Jennie Murray, David Parry, Andrea Robertson, Roberto Bellelli, Žygimantė Tarnauskaitė, Rachel Challis, Louise Cleal, Valérie Borel, Adeline Fluteau, Javier Santoyo‐López, Timothy J. Aitman, Andrew V. Biankin, Susanna L. Cooke, Wendy Inglis Humphrey, Sancha Martin, Lynne J. Mennie, Alison Meynert, Zosia Miedzybrodzka, Fiona Murphy, Craig Nourse, Colin A. Semple, Nicola Williams, Inês Barroso, Donald Basel, Louise S. Bicknell, Himanshu Goel, Hao Hu, Chad Huff, Michele R. Hutchison, Caroline Joyce, Rachel Knox, Amy E. Lacroix, Sylvie Langlois, Shawn E. McCandless, Julie McCarrier, Kay Metcalfe, Rose Morrissey, Nuala Murphy, Irène Netchine, Susan O’Çonnell, Ann Haskins Olney, Nandina Paria, Jill A. Rosenfeld, Mark Sherlock, Erin Syverson, Perrin C. White, Carol A. Wise, Yao Yu, Margaret Zacharin, Indraneel Banerjee, Martin A.M. Reijns, Michael B. Bober, Robert K. Semple, Simon J. Boulton, Jonathan J. Rios, Andrew P. Jackson

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research CouncilChief Scientist Office, Scottish Government Health and Social Care DirectorateScottish GovernmentEuropean Research CouncilCancer Research UKNational Institutes of HealthFrancis Crick InstituteWellcome Trust
Mots-clésCommon variable immunodeficiencyImmunodeficiencyPolymeraseDNA polymeraseDNAVirologyBiologyGeneticsAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During genome replication, polymerase epsilon (Pol ε) acts as the major leading-strand DNA polymerase. Here we report the identification of biallelic mutations in POLE, encoding the Pol ε catalytic subunit POLE1, in 15 individuals from 12 families. Phenotypically, these individuals had clinical features closely resembling IMAGe syndrome (intrauterine growth restriction [IUGR], metaphyseal dysplasia, adrenal hypoplasia congenita, and genitourinary anomalies in males), a disorder previously associated with gain-of-function mutations in CDKN1C. POLE1-deficient individuals also exhibited distinctive facial features and variable immune dysfunction with evidence of lymphocyte deficiency. All subjects shared the same intronic variant (c.1686+32C>G) as part of a common haplotype, in combination with different loss-of-function variants in trans. The intronic variant alters splicing, and together the biallelic mutations lead to cellular deficiency of Pol ε and delayed S-phase progression. In summary, we establish POLE as a second gene in which mutations cause IMAGe syndrome. These findings add to a growing list of disorders due to mutations in DNA replication genes that manifest growth restriction alongside adrenal dysfunction and/or immunodeficiency, consolidating these as replisome phenotypes and highlighting a need for future studies to understand the tissue-specific development roles of the encoded proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations106
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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