HIV-associated sensory polyneuropathy and neuronal injury are associated with miRNA–455-3p induction
Notice bibliographique
Résumé
Symptomatic distal sensory polyneuropathy (sDSP) is common and debilitating in people with HIV/AIDS, leading to neuropathic pain, although the condition's cause is unknown. To investigate biomarkers and associated pathogenic mechanisms for sDSP, we examined plasma miRNA profiles in HIV/AIDS patients with sDSP or without sDSP in 2 independent cohorts together with assessing related pathogenic effects. Several miRNAs were found to be increased in the Discovery Cohort (sDSP, n = 29; non-DSP, n = 40) by array analyses and were increased in patients with sDSP compared with patients without sDSP. miR-455-3p displayed a 12-fold median increase in the sDSP group, which was confirmed by machine learning analyses and verified by reverse transcription PCR. In the Validation Cohort (sDSP n = 16, non-DSP n = 20, healthy controls n = 15), significant upregulation of miR-455-3p was also observed in the sDSP group. Bioinformatics revealed that miR-455-3p targeted multiple host genes implicated in peripheral nerve maintenance, including nerve growth factor (NGF) and related genes. Transfection of cultured human dorsal root ganglia with miR-455-3p showed a concentration-dependent reduction in neuronal β-III tubulin expression. Human neurons transfected with miR-455-3p demonstrated reduced neurite outgrowth and NGF expression that was reversed by anti-miR-455-3p antagomir cotreatment. miR-455-3p represents a potential biomarker for HIV-associated sDSP and might also exert pathogenic effects leading to sDSP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».