1261. Utility of a Multiplex Molecular Gastrointestinal Panel in Rapid Identification and Control of a Norovirus Outbreak in a Pediatric Tertiary Care Center
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Norovirus is one of the most common viral pathogens implicated in gastroenteritis outbreaks in community and healthcare settings. The virus’ short incubation period and high attack rate allow its rapid spread through inpatient wards to patients (Patients), staff and visitors. Early identification and appropriate implementation of infection prevention and control measures is essential to interrupt transmission. Methods The IWK Health Centre is a 250-bed tertiary care Pediatric and Women’s hospital serving the Maritime Provinces, Canada. We describe a norovirus outbreak in our Pediatric Medical Unit, a 24-bed, single room ward with individual bathrooms for patients and families. Hospital-acquired norovirus definition: Patients admitted ≥48 hours with lab-confirmed norovirus AND ≥ 1 of: (1) acute onset diarrhea (no noninfectious cause) or (2) ≥2 of: nausea, vomiting, abdominal pain, fever, or headache. In 2017 the FilmArray Gastrointestinal (GI) Panel was introduced in the Clinical Microbiology Laboratory as part of a prospective post-implementation study. Since then, stool samples sent for viral, bacterial, or parasitic testing are evaluated by PCR. The panel tests for 22 GI analytes, including five viruses, with a 2-hour turnaround time. Previously, in-house stool viral testing was limited to adeno- and rotavirus antigen. Patient characteristics were collected and analyzed for this study. Results Patients 1, 2, and 3 had new onset diarrhea and emesis; Pt 1 on day 0, and Patients 2 and 3 on day 1. Patient 3’s parents (likely source) had had diarrhea and emesis on days 3 and 2, and used the ward kitchen. Two care-givers of Patient 2, and 1 medical resident developed diarrhea and emesis over days 0 to 2. The outbreak was declared over on day 7. Patients 1, 2, and 3 all tested positive for norovirus in stool on day 1. On days 2–3, six other patients with diarrhea tested norovirus negative. All symptomatic patients were immediately placed on contact precautions, room/ward cleaning frequency increased and proper hand hygiene was reinforced. Common areas (playroom/kitchen) were closed until the outbreak was over. All patients with loose stool were tested during the outbreak. Conclusion FilmArrayGI panel enabled same-day identification of norovirus in this single-ward outbreak and permitted real-time identification of the termination of the outbreak. Disclosures All authors: No reported disclosures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».