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Enregistrement W2902767496 · doi:10.1097/pas.0000000000001196

Novel PLAG1 Gene Rearrangement Distinguishes a Subset of Uterine Myxoid Leiomyosarcoma From Other Uterine Myxoid Mesenchymal Tumors

2018· article· en· W2902767496 sur OpenAlexaff
Javier Arias‐Stella, Ryma Benayed, Esther Oliva, Robert H. Young, Lien Hoang, Cheng‐Han Lee, Achim A. Jungbluth, Denise Frosina, Robert A. Soslow, Cristina R. Antonescu, Marc Ladanyi, Sarah Chiang

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueUterine Myomas and Treatments
Établissements canadiensBC Cancer AgencyVancouver General Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésFluorescence in situ hybridizationLeiomyosarcomaPathologyNuclear atypiaImmunohistochemistryBiologyHMGA2Gene rearrangementMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic alterations in uterine myxoid leiomyosarcoma are unknown. We investigate the clinicopathologic features of 19 uterine tumors previously diagnosed as myxoid leiomyosarcomas in which tumoral RNA was subjected to targeted RNA sequencing. PLAG1, BCOR, BCORL1, HMGA2, and ALK break-apart fluorescence in situ hybridization (FISH) and BCOR, PLAG1, and ALK immunohistochemistry were performed in cases which failed or lacked fusions by sequencing. The diagnosis of myxoid leiomyosarcoma was confirmed in 15 cases after exclusion of 4 tumors with BCOR and ALK rearrangements. These 15 patients presented at a median age of 50 years with stage I (3), II (2), III (2), and IV (1) tumors, respectively; stage was unknown in 7 cases. Tumor size ranged from 10 to 24 cm. Matrix was myxoid in all tumors and also eosinophilic in 2. Cells were spindled, epithelioid, and both in 10, 2, and 3 tumors and showed mild, moderate, and severe nuclear atypia in 3, 8, and 4 tumors, respectively. Mitotic index ranged from <1 to 14/10 HPF, while tumor necrosis was present in 6 (40%). Novel TRPS1-PLAG1 or RAD51B-PLAG1 fusions were detected by sequencing in 4 tumors, 3 of which were also confirmed by FISH. Diffuse PLAG1 expression was seen in 7 tumors, including 4 with PLAG1 rearrangement. No morphologic differences were seen among PLAG1 fusion-positive and fusion-negative tumors. No PLAG1, HMGA2, ALK, BCOR, or BCORL1 rearrangements were detected by FISH in 11 tumors. On the basis of sequencing and FISH results, PLAG1 rearrangements resulting in PLAG1 expression underpin ~25% of myxoid leiomyosarcomas and may serve as a useful diagnostic biomarker. Immunohistochemistry, targeted RNA sequencing, and/or FISH may distinguish myxoid leiomyosarcoma from its morphologic mimics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,682
Score d'incertitude au seuil0,780

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations99
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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