Remediation of deterioration in microbial structure in continuous <i>Pinellia ternata</i> cropping soil by crop rotation
Notice bibliographique
Résumé
Pinellia ternata is a traditional Chinese herb that suffers from continuous cropping (CC), which significantly decreases both yield and quality. The influence of CC on the microbiome in P. ternata rhizosphere and the effects of remediation on microbiota by rotational cropping (CR) were assessed by Illumina high-throughput sequencing technology. CC tends to decrease the α-diversities as a function of cultivation time, whereas CR tends to increase them. Differentially abundant analysis showed that microbial structure was important in maintaining the health status of P. ternata rhizosphere. Results suggested that CC soils were mainly enriched for Pseudomonas, Rhizobium, and Streptophyta operational taxonomic units (OTUs), while the CR soils were mainly enriched for Rhizobium, Pseudomonas, Flavobacterium, Sphingomonas, Rhizobacter, and Arthrobacter OTUs. On the basis of the community dissimilarities, we grouped all sample replicates into three post hoc clusters in which soils were defined as healthy, health-suppressed, and health-depressed soils. The three soil types represented different soil physicochemical properties. The activities of the microbiome features, including ammonia oxidizer, sulfate reducer, nitrite reducer, dehalogenation, xylan degrader, sulfide oxidizer, nitrogen fixation, atrazine metabolism, chitin degradation, degraded aromatic hydrocarbons, and chlorophenol degradation, were also considerably different among the three soils.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».