Epidemiology of invasive pneumococcal disease in indigenous and non-indigenous adults in northwestern Ontario, Canada, 2006–2015
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Despite the use of pneumococcal vaccines, indigenous populations are consistently disproportionately affected by invasive pneumococcal disease (IPD). With recent changes in Ontario's provincial pneumococcal vaccination program, we sought to evaluate the epidemiology and burden of IPD in northwestern Ontario (NWO) Canada - a region that contains a substantial (19.2%) indigenous population. METHODS: We retrospectively reviewed all adult cases of IPD that were reported to the Thunder Bay District Health Unit, in Thunder Bay, Ontario, Canada, over a 10-year period (2006-2015). Patients admitted to the Thunder Bay Regional Health Sciences Centre with IPD had their charts reviewed to abstract clinical data. Statistical analysis, including incidence rates of IPD, was performed. RESULTS: Two hundred sixty-two cases of IPD occurred over the 10-year observation period and clinical data was available for 182 cases. Fifty-three of 182 (29.1%) patients were indigenous. 73 of 182 (40.1%) of patients were immunocompromised. Indigenous patients with IPD were more likely to be immunocompromised than non-indigenous patients (p < 0.001). Serotype data was available for 159 cases of IPD; PCV7, PCV13, and PPV23 covered 5.7%, 28.3%, and 79.2% of isolates, respectively, while 29 (20.8%) were non-vaccine serotypes. The annual incidence rate of IPD ranged from 8.9 to 25.9 per 100,000 among adults 18-64 years old; among adults 65 years of age and older the annual incidence of IPD ranged from 18.5 to 60.7 per 100,000. CONCLUSION: Among adults in NWO, Canada, there is a high incidence of IPD. Immunocompromised indigenous adults in NWO may benefit from pneumococcal vaccination coverage. Emerging non-vaccine serotypes of Streptococcus pneumoniae warrant the consideration of the provincial pneumococcal vaccination program.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».