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Enregistrement W2902893008 · doi:10.3390/ijms19123817

Unambiguous Ex Situ and in Cell 2D 13C Solid-State NMR Characterization of Starch and Its Constituents

2018· article· en· W2902893008 sur OpenAlexafffund
Alexandre Poulhazan, Alexandre A. Arnold, Dror E. Warschawski, Isabelle Marcotte

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueFood composition and properties
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCentre National de la Recherche ScientifiqueUniversité du Québec à Montréal
Mots-clésStarchAmyloseAmylopectinCrystallinitySolid-state nuclear magnetic resonanceChemistryCarbon-13 NMRAmorphous solidIn situBiochemistryOrganic chemistryCrystallographyNuclear magnetic resonance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Starch is the most abundant energy storage molecule in plants and is an essential part of the human diet. This glucose polymer is composed of amorphous and crystalline domains in different forms (A and B types) with specific physicochemical properties that determine its bioavailability for an organism, as well as its value in the food industry. Using two-dimensional (2D) high resolution solid-state nuclear magnetic resonance (SS-NMR) on 13C-labelled starches that were obtained from Chlamydomonas reinhardtii microalgae, we established a complete and unambiguous assignment for starch and its constituents (amylopectin and amylose) in the two crystalline forms and in the amorphous state. We also assigned so far unreported non-reducing end groups and assessed starch chain length, crystallinity and amylose content. Starch was then characterized in situ, i.e., by 13C solid-state NMR of intact microalgal cells. Our in-cell methodology also enabled the identification of the effect of nitrogen starvation on starch metabolism. This work shows how solid-state NMR can enable the identification of starch structure, chemical modifications and biosynthesis in situ in intact microorganisms, eliminating time consuming and potentially altering purification steps.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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