Abstract PR12: Histone H3K36 mutations promote sarcomagenesis through altered histone methylation landscape
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Several types of bone/cartilage tumors reportedly contain high-frequency missense mutations in histone H3, yet the underlying oncogenic mechanism remains poorly characterized. We find that the H3 lysine 36 to methionine (H3K36M) mutation, identified in >90% of chondroblastomas, impairs the differentiation of mesenchymal progenitor cells and generates undifferentiated sarcoma in vivo. H3K36M mutant nucleosomes inhibit the enzymatic activities of several H3K36 methyltransferases, resulting in globally diminished H3K36 methylation. Depletion of H3K36 methyltransferases, or expressing an H3K36I mutant that similarly inhibits H3K36 methylation, is sufficient to phenocopy H3K36M mutation. Following the loss of H3K36 methylation, a genome-wide gain in H3K27 methylation leads to a redistribution of polycomb repressive complex 1 and de-repression of polycomb target genes known to block mesenchymal differentiation. Our findings are mirrored in human undifferentiated sarcomas where novel K36M/I mutations in H3.1 are identified in rare pediatric cases. This abstract is also being presented as Poster A12. Citation Format: Chao Lu, Siddhant Jain, Dominik Hoelper, Denise Bechet, Leili Ran, Irene Andrulis, Brendan Dickson, Jacek Majewski, Craig Thompson, Ping Chi, Benjamin Garcia, Nada Jabado, Peter Lewis, C. David Allis. Histone H3K36 mutations promote sarcomagenesis through altered histone methylation landscape [abstract]. In: Proceedings of the AACR Conference on Advances in Sarcomas: From Basic Science to Clinical Translation; May 16-19, 2017; Philadelphia, PA. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2018;24(2_Suppl):Abstract nr PR12.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».