Spatial and Temporal Distribution of Aedes Species and Their Infection Status by Dengue and Chikungunya Viruses along the Coastline of Kenya
Notice bibliographique
Résumé
A surge in outbreaks of arboviral infections has been documented in spots along Kenyan Coast. However, there is paucity of documented information on distribution of Aedes species involved in transmission of arboviruses and their infection status. This study determined spatial and temporal distribution of Aedes species and their infection status for Dengue (DENV) and Chikungunya (CHIKV) arboviruses along the coastline of Kenya during dry and wet seasons. Indoor and outdoor sampling of adults Aedes species was done using Biogent Sentinel trap baited with solid carbon dioxide and aspiration technique. Samples were identified to sex and species by morphological features. Sites coordinates were noted by GPS with maps drawn using geomap and ggplot packages. RNA from the samples was extracted using Trizole®. cDNA was generated from RNA using one step real time PCR for identification of arboviruses. Proportions of arboviruses were analyzed by R-statistics. A total of 37,220 Aedes mosquitoes were collected and pooled in pools of 20 mosquitoes. Aedes species identified and their respective proportions were: Aedes aegypti formosus (62.5%), Aedes aegypti aegypti (13.2%), Aedes mcintoshi (9.56%), Aedes ochraceus (5.79%), Aedes pembaensis (5.51%), Aedes tricholabis (1.31%), Aedes albicosta (1.11%), Aedes fulgens (0.54%) and Aedes fryeri (0.43%). Aedes aegypti aegypti had not been identified along the coastline in previous studies. The Aedes mosquito sample sizes and their distribution along the coastline were insignificantly different between the two seasons. Vector infections by DENV and CHIKV were insignificantly different between the seasons. In this study, DENV-4 was identified in Aedes species along the coastline of Kenya. Our data confirms the previous reports for increased risk of infection during wet seasons and further identifies other regions with increased risk of arboviral transmission along Coastal Kenya. This information is important as it gives knowledge on areas at high risk for arboviral disease outbreaks in cases where human-vector contacts occur. Consecutively, up scaled survey and implementation of control and prevention measures should be taken appropriately.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».