Effects of nuclear factor I phosphorylation on calpastatin (CAST) gene variant expression and subcellular distribution in malignant glioma cells
Notice bibliographique
Résumé
Malignant glioma (MG) is the most lethal primary brain tumor. In addition to having inherent resistance to radiation treatment and chemotherapy, MG cells are highly infiltrative, rendering focal therapies ineffective. Genes involved in MG cell migration and glial cell differentiation are up-regulated by hypophosphorylated nuclear factor I (NFI), which is dephosphorylated by the phosphatase calcineurin in MG cells. Calcineurin is cleaved and thereby activated by calpain proteases, which are, in turn, inhibited by calpastatin (CAST). Here, we show that the CAST gene is a target of NFI and has NFI-binding sites in its intron 3 region. We also found that NFI-mediated regulation of CAST depends on NFI's phosphorylation state. We noted that occupation of CAST intron 3 by hypophosphorylated NFI results in increased activation of an alternative promoter. This activation resulted in higher levels of CAST transcript variants, leading to increased levels of CAST protein that lacks the N-terminal XL domain. CAST was primarily present in the cytoplasm of NFI-hypophosphorylated MG cells, with a predominantly perinuclear immunostaining pattern. NFI knockdown in NFI-hypophosphorylated MG cells increased CAST levels at the plasma membrane. These results suggest that NFI plays an integral role in the regulation of CAST variants and CAST subcellular distribution. Along with the previous findings indicating that NFI activity is regulated by calcineurin, these results provide a foundation for further investigations into the possibility of regulatory cross-talk between NFI and the CAST/calpain/calcineurin signaling pathway in MG cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».