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Enregistrement W2903411193 · doi:10.1371/journal.ppat.1007414

Soil humic acids degrade CWD prions and reduce infectivity

2018· article· en· W2903411193 sur OpenAlexafffund
Alsu Kuznetsova, Catherine I. Cullingham, Debbie McKenzie, Judd M. Aiken

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismAlberta Prion Research InstituteAlberta Agriculture and ForestryGenome AlbertaAlberta InnovatesGenome Canada
Mots-clésChronic wasting diseaseInfectivityIncubationSoil waterIncubation periodOrganic matterPrion proteinBiologyEnvironmental chemistryEcologyChemistryVirologyDiseaseBiochemistryVirusInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic wasting disease (CWD), an environmentally transmissible, fatal prion disease is endemic in North America, present in South Korea and has recently been confirmed in northern Europe.The expanding geographic range of this contagious disease of free-ranging deer, moose, elk and reindeer has resulted in increasing levels of prion infectivity in the environment.Soils are involved in CWD horizontal transmission, acting as an environmental reservoir, and soil mineral and organic compounds have the ability to bind prions.Upper horizons of soils are usually enriched with soil organic matter (SOM), however, the role of SOM in prion conservation and mobility remains unclear.In this study, we show that incubation of PrP CWD with humic acids (HA), a major SOM compound, affects both the molecular weight and recovery of PrP CWD .Detection of PrP CWD is reduced as HA concentration increases.Native HA extracted from pristine soils also reduces or entirely eliminates PrP CWD signal.Incubation of CWD prions with HA significantly increased incubation periods in tgElk mice demonstrating that HA can reduce CWD infectivity. Author summaryChronic wasting disease (CWD) is a contagious prion disease affecting several species of captive and wild cervids.Environmental prion contamination plays a major role in increasing incidence of CWD, with CWD infectivity being released into the environment by decaying carcasses, or shedding of biological fluids including urine, feces, and saliva.Horizontal transmission of CWD involves soils as an environmental reservoir of infectivity.Here, we tested the role of a soil organic matter compound, humic acid, for its ability to bind CWD prions and impact infectivity.A wide range of humic acid concentrations were examined representing the extensive spectrum of humic acid levels present in native soils.We found that incubation of CWD prions with high concentrations of humic acids (>2.5 g L -1 ) decreases the both CWD-prion signal and infectivity, whereas lower levels of humic acids did not significantly impact protein stability or infectivity.Our study provides new insights into soil-prion interactions, prions persistence in soil, and their bioavailability to grazing animals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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