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Enregistrement W2903416893 · doi:10.1038/s41467-018-07340-5

GWAS and colocalization analyses implicate carotid intima-media thickness and carotid plaque loci in cardiovascular outcomes

2018· review· en· W2903416893 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2018
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of British ColumbiaMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteMedical Research CouncilNational Cancer InstituteUniversitat Autònoma de BarcelonaSchool of Medicine, Emory UniversityNovo Nordisk FondenScience for Life LaboratoryTerveyden ja hyvinvoinnin laitosFondazione I.R.C.C.S. Istituto Neurologico Carlo BestaJohns Hopkins UniversityChildren's National HospitalUppsala UniversitetNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesDeutsche ForschungsgemeinschaftBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute on AgingNational Institute for Health and Care ResearchAgence Nationale de la RechercheUniversity College LondonHope Center for Neurological DisordersWellcome TrustNational Institutes of HealthRosetrees TrustEuropean CommissionGeorge Washington UniversityHunter Medical Research InstituteAflacNational Institute of Neurological Disorders and StrokeBritish Heart FoundationEmory UniversityRoyal Holloway, University of LondonBrigham and Women's HospitalYale UniversityUniversity of Texas Health Science Center at HoustonNational Heart, Lung, and Blood InstituteChildren’s Hospital of Wisconsin Research InstituteAmerican Heart Association
Mots-clésGenome-wide association studyColocalizationIntima-media thicknessMedicineCardiologyInternal medicineCarotid arteriesBiologyGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGenotypeNeuroscienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Carotid artery intima media thickness (cIMT) and carotid plaque are measures of subclinical atherosclerosis associated with ischemic stroke and coronary heart disease (CHD). Here, we undertake meta-analyses of genome-wide association studies (GWAS) in 71,128 individuals for cIMT, and 48,434 individuals for carotid plaque traits. We identify eight novel susceptibility loci for cIMT, one independent association at the previously-identified PINX1 locus, and one novel locus for carotid plaque. Colocalization analysis with nearby vascular expression quantitative loci (cis-eQTLs) derived from arterial wall and metabolic tissues obtained from patients with CHD identifies candidate genes at two potentially additional loci, ADAMTS9 and LOXL4. LD score regression reveals significant genetic correlations between cIMT and plaque traits, and both cIMT and plaque with CHD, any stroke subtype and ischemic stroke. Our study provides insights into genes and tissue-specific regulatory mechanisms linking atherosclerosis both to its functional genomic origins and its clinical consequences in humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,924
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,384
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle