Top‐down lignomic matrix‐assisted laser desorption/ionization time‐of‐flight tandem mass spectrometry analysis of lignin oligomers extracted from date palm wood
Notice bibliographique
Résumé
Rationale We report for the first time the top‐down lignomic analysis of the virgin released lignin (VRL) oligomers obtained from the Saudi date palm wood (SDPW), using a matrix‐assisted laser desorption/ionization time‐of‐flight/time‐of‐flight (MALDI‐TOF/TOF) instrument. In addition, we are proposing new collision‐induced dissociation tandem mass spectrometry (CID‐MS/MS) fragmentation routes for this series of unreported VRL oligomers. Methods We have used direct MALDI‐TOF‐MS analysis of the mixture of lignin oligomers without any chromatographic pre‐separation. High‐energy CID‐MS/MS analyses were used to confirm the precursor ion structures. Results Six protonated lignin oligomer molecules were identified: [C 19 H 24 O 8 + H] + as H(8‐O‐4')G; [C 50 H 52 O 19 + H] + as H(8‐O‐4')H(8‐O‐4'')S(8‐O‐4''')S(8‐O‐4'''')G; [C 58 H 54 O 18 + H] + as H(8‐O‐4')H(8‐O‐4'')H(8‐O‐4''')G(8‐O‐4'''')S(8‐O‐4''''')G; [C 58 H 54 O 19 + H] + as H(8‐O‐4')H(8‐O‐4'')H(8‐O‐4''')S(8‐O‐4'''')S(8‐O‐4''''')G; [C 61 H 68 O 25 + H] + as H(8‐O‐4')G(8‐O‐4'')G(8‐O‐4''')S(8‐O‐4'''')S(8‐O‐4''''')G; and [C 61 H 68 O 26 + H] + as C(8‐O‐4')G(8‐O‐4'')G(8‐O‐4''')S(8‐O‐4'''')S(8‐O‐4''''')G units (H = coniferyl, S = sinapyl, and G = p ‐coumaryl). Two distonic cations were identified as [C 39 H 43 O 15 + H] +• and [C 40 H 43 O 16 + H] +• deriving from two tetrameric lignin oligomers. The high‐energy MS/MS analyses allowed the confirmation of the proposed structures of this series of lignin oligomers. Conclusions To our knowledge, this is the first elucidation of the lignin structure of the Saudi seedling date palm wood that was accomplished using a top‐down lignomic strategy that has not previously been published. The complex high‐energy CID‐MS/MS fragmentations presented herein are novel and have never been described before.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».