Revision of root-associated microfungi of <i>Pinus wallichiana</i> in Kashmir Himalaya
Notice bibliographique
Résumé
Fungi associated with roots of Pinus wallichiana A.B. Jackson were evaluated for the first time in the recently published study by Tyub et al. (2018, Can. J. For. Res. 48(8): 923–929, doi: 10.1139/cjfr-2018-0084 ). A culture-free approach using RFLP profiling and the sequencing analysis of DNA extracted from fine root tips was used to identify ectomycorrhizal and other species present in the roots; however, numerous inconsistences in the interpretation of presented results indicated that the names assigned to particular sequences were incorrect. Therefore, sequences belonging to ascomycete microfungi (predominantly members of Helotiales) obtained in the study were reanalyzed to confirm their identification. A simple phylogenetic analysis also utilizing closely related sequences from GenBank showed that the sequences from this study were mostly misidentified (i.e., placed in different clades than sequences having the same name but originating from taxonomic studies). Erroneous conclusions resulting from misidentified species and limited knowledge of relevant literature were corrected. Despite numerous inconsistences, the study of Tyub et al. (2018) brought valuable data about fungal diversity and potential taxonomic novelties among helotialean fungi associated with coniferous roots.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».