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Enregistrement W2903551834 · doi:10.1242/jeb.195198

Hif-1α paralogs play a role in the hypoxic ventilatory response of larval and adult zebrafish (<i>Danio rerio</i>)

2018· article· en· W2903551834 sur OpenAlexafffund
Milica Mandic, Velislava Tzaneva, Vincent Careau, Steve F. Perry

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience of respiration and sleep
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDanioZebrafishHypoxic ventilatory responseBiologyLarvaHypoxia (environmental)Cell biologyRespiratory systemZoologyAnatomyEcologyGeneGeneticsChemistryOxygen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypoxia inducible factor (Hif) 1α, an extensively studied transcription factor, is involved in the regulation of many biological processes in hypoxia including the hypoxic ventilatory response. In zebrafish, there are two paralogs of Hif-1α (Hif-1A and Hif-1B), but little is known about the specific roles or potential sub-functionalization of the paralogs in response to hypoxia. Using knockout lines of Hif-1α paralogs, we examined their involvement in the hypoxic ventilatory response, measured as ventilation frequency (fV) in larval and adult zebrafish (Danio rerio). In wild-type zebrafish, fV increased across developmental time [4 days post fertilization (dpf), 7 dpf, 10 dpf and 15 dpf] in response to hypoxia (55 mmHg). In contrast, the Hif-1B knockout fish did not exhibit an increase in hypoxic fV at 4 dpf. Similar to wild-types, as larvae of all knockout lines developed, the magnitude of fV increased but to a lesser degree than in the wild-type larvae, until 15 dpf at which point there was no difference among the genotypes. In adult zebrafish, only in Hif-1B knockout fish was there an attenuation in fV during sustained exposure to 30 mmHg for 1 h but no effect when exposed for a shorter duration to progressive hypoxia. The mechanism of action of Hif-1α, in part, may be through its downstream target, nitric oxide synthase (NOS), and its product, nitric oxide (NO). Overall, the effect of each Hif-1α paralog on the hypoxic ventilatory response of zebrafish varies over development and is dependent on the type of hypoxic stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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