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Enregistrement W2903563260 · doi:10.1017/s0022149x18001104

Molecular characterization of<i>Neoechinorhynchus cylindratus</i>Van Cleave, 1913 (Acanthocephala: Neoechinorhynchidae), a parasite of the largemouth bass (<i>Micropterus salmoides</i>) in northern Mexico

2018· article· en· W2903563260 sur OpenAlexaboutno aff
Martín García‐Varela, Carlos Daniel Pinacho-Pinacho

Notice bibliographique

RevueJournal of Helminthology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueParasite Biology and Host Interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAcanthocephalaMicropterusZoologyPhylogenetic treeParaphylyCytochrome c oxidase subunit ISpecies complexEcologyBass (fish)CladeHelminthsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Members of the genus Neoechinorhynchus Stiles & Hassall, 1905 are endoparasites of freshwater fishes, brackish water fishes, and freshwater turtles distributed worldwide. In North America, 33 species have been described. One of the most widely distributed species in the eastern United States and Canada is Neoechinorhynchus (Neoechinorhynchus) cylindratus, a common acanthocephalan that infects centrarchid fishes. In the current study, adult specimens of N. (N) cylindratus were collected from largemouth bass (Micropterus salmoides) from the Purificación River in northern Mexico. In the same freshwater system, two additional congeneric species (Neoechinorhynchus (Neoechinorhynchus) emyditoides and Neoechinorhynchus (Neoechinorhynchus) panucensis) were collected and analysed. Sequences of the large subunit, internal transcribed spacers ITS1 and ITS2, 5.8S from nuclear DNA, and sequences of the cytochrome c oxidase subunit I (cox 1) from mitochondrial DNA were generated and aligned with other sequences obtained from GenBank. Maximum likelihood and Bayesian inference analyses inferred for each dataset showed that N. (N) panucensis, N. (N) emyditoides and N. (N) cylindratus were nested within several clades, indicating that these species do not share a common ancestor. Our phylogenies also revealed that the genus Neoechinorhynchus is paraphyletic, requiring further taxonomic revision using phylogenetic systematics and re-examination of morphological and ecological data. The presence of several N. (N) cylindratus adults in northern Mexico allowed us to typify this species for the first time using a combination of morphological and molecular characteristics. The current record shows a wide distribution range of N. (N) cylindratus across Canada, the United States and Mexico in the Nearctic region.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,224
Score d'incertitude au seuil0,628

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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