Effect of a locally adapted genome on environmentally induced epigenetic variation
Notice bibliographique
Résumé
Both genetic variation and environmentally induced epigenetic changes allow organisms to persist through the heterogeneity of their habitats.Selection on genetic variation can promote local adaptation of populations.However, in absence of genetic variation, clonal organisms mostly rely on epigenetics to respond to environmental heterogeneity.We used the potential of unisexual organisms in incorporating their host genome, to empirically assess whether the presence of a locally adapted genome affects environmentally induced epigenetic changes in clonal organisms.We addressed this problematic by using unisexual lineages of the kleptogen vertebrate Ambystoma laterale-jeffersonianum complex that can optionally incorporate genetic material from locally adapted sexual hosts through genomic exchanges.More specifically, we compared environmentally induced epigenetic changes between lineages strictly reproducing clonally vs. those incorporating a locally adapted genome.The results revealed that both lineage and sample site components, as well as their interaction, affected epigenetic variation.When lineages were analysed separately, differences among sample sites were only detected in lineages impervious to genomic exchanges.Sample sites had no significant effect on the epigenetic variation of lineages that performed genomic exchanges.These results suggest that environmentally induced epigenetic variation among sites depends more on the lack of locally adapted alleles than on the level of genetic variation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».