Digital Microscopy, Image Analysis, and Virtual Slide Repository
Notice bibliographique
Résumé
Advancements in technology and digitization have ushered in novel ways of enhancing tissue-based research via digital microscopy and image analysis. Whole slide imaging scanners enable digitization of histology slides to be stored in virtual slide repositories and to be viewed via computers instead of microscopes. Easier and faster sharing of histologic images for teaching and consultation, improved storage and preservation of quality of stained slides, and annotation of features of interest in the digital slides are just a few of the advantages of this technology. Combined with the development of software for digital image analysis, digital slides further pave the way for the development of tools that extract quantitative data from tissue-based studies. This review introduces digital microscopy and pathology, and addresses technical and scientific considerations in slide scanning, quantitative image analysis, and slide repositories. It also highlights the current state of the technology and factors that need to be taken into account to insure optimal utility, including preanalytical considerations and the importance of involving a pathologist in all major steps along the digital microscopy and pathology workflow.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,008 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,005 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».