Linking biological and geological data on dinoflagellates using the genus <i>Spiniferites</i> as an example: the implications of species concepts, taxonomy and dual nomenclature
Notice bibliographique
Résumé
Dinoflagellates encompass two taxonomic systems (dual taxonomy) reflected by separate traditions of nomenclature: one based mainly on living motile stages, and the other mainly on fossil cysts (dual nomenclature). Modern cysts may therefore bear two names if their life cycle is known. There have been attempts to rationalize this duality, but at species and genus level this has been largely unfruitful. New and continuing developments call for a renewed evaluation of this duality: (1) the elucidation of multiple new cyst–motile stage relationships creating overlaps between cyst-based and motile-based systems, and (2) the advent of DNA sequence-based phylogenies, revealing evolutionary patterns (underlying the phenotypic differences) that disagree with trees obtained from the study of fossil cysts. We examine the background of dual nomenclature and discuss the implications of new advances in molecular phylogeny for dual taxonomy as well as briefly review earlier attempts to unite cyst/fossil and motile-/living-based nomenclatures. From this basis, we explore routes for bringing the separate taxonomic systems closer together. Our rationale for doing this lies in the challenges facing communication between the biologists and geologists who work on these different life cycle stages. These challenges encompass taxonomic issues, nomenclature, evolutionary interpretations, and the nature of what we perceive as a species. We use the motile/cyst pair Gonyaulax/Spiniferites as our example, as these, and related genera, provide a useful model for illustrating the difficulties in bridging the gap between biology and palaeontology because they are numerous, with regard to both species and specimens, and are ubiquitous in both time and space.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».