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Enregistrement W2903840193 · doi:10.1111/vox.12729

Biofilm‐associated accumulation‐associated protein (Aap): A contributing factor to the predominant growth of <i>Staphylococcus epidermidis</i> in platelet concentrates

2018· article· en· W2903840193 sur OpenAlexafffund
Meshari Alabdullatif, Sandra Ramírez‐Arcos

Notice bibliographique

RevueVox Sanguinis · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensCanadian Blood ServicesUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesHealth CanadaCanadian Blood Services
Mots-clésStaphylococcus epidermidisBiofilmMicrobiologyBacteriaBiologyStaphylococcus aureusGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND OBJECTIVES: Staphylococcus epidermidis is a predominant contaminant of platelet concentrates (PCs), outcompeting other skin flora bacteria such as Staphylococcus capitis. The accumulation-associated protein (Aap), encoded by the aap gene, is involved in formation of bacterial aggregates (biofilms) in S. epidermidis and is absent in S. capitis. In this study, the role of S. epidermidis aap in enhancing biofilm formation and conferring an advantageous growth in PCs was investigated. MATERIALS AND METHODS: Biofilm formation assays of S. epidermidis 1457, S. epidermidis 1457∆aap, S. capitis 517 and S. capitis 517 carrying S. epidermidis aap (S. capitis 517/pRBaap) were performed in glucose-supplemented trypticase soy broth (TSBg) and PCs. Additionally, competition assays with paired cultures (1:1 ratio) of S. epidermidis and S. capitis strains were seeded in PCs, followed by determination of viable counts of each organism at the end of PC storage. RESULTS: Staphylococcus epidermidis aap had no effect on biofilm formation in TSBg. By contrast in PCs, S. epidermidis 1457 showed higher biofilm formation than S. epidermidis 1457∆aap (P < 0·05). Biofilm formation was also enhanced in S. capitis 517/pRBaap compared to S. capitis 517 (P = 0·054). Competition assays showed that S. epidermidis 1457 outcompeted S. capitis 517, and importantly, S. capitis 517/pRBaap outcompeted S. capitis 517 and S. epidermidis 1457∆aap. CONCLUSION: This study demonstrated that S. epidermidis aap plays a role in biofilm formation in PCs conferring an advantageous proliferation to skin flora bacteria in this milieu. The molecular mechanisms of action of Aap merit further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,738

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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