Recombination in a natural population of the bdelloid rotifer <i>Adineta vaga</i>
Notice bibliographique
Résumé
Sexual reproduction which involves alternation of meiosis and syngamy is the ancestral condition of extant eukaryotes. Transitions to asexual reproduction were numerous, but most of the resulting eukaryotic lineages are rather short-lived. Still, there are several exceptions to this rule including darwinulid ostracods 1,2 and timema stick insects 3 . The most striking of them is bdelloid rotifers 4 – 6 , microscopic freshwater invertebrates which underwent an extensive adaptive radiation after apparently losing meiosis over 10 Mya. Indeed, both the lack of males in numerous bdelloid species and the lack of proper homology between chromosomes 6 rule out ordinary sex. However, this does not exclude the possibility of some other mode of interindividual genetic exchange and recombination in their populations 7 . Recent analyses based on a few loci suggested genetic exchanges in this group 8,9 , although this has been controversial 10 . Here, we compare complete genomes of 11 individuals from the wild population of the bdelloid rotifer Adineta vaga, and show that its genetic structure, which involves Hardy-Weinberg proportions of genotypes within loci and lack of linkage disequilibrium between distant loci, is incompatible with strictly clonal reproduction. Instead, it can emerge only under ongoing recombination between different individuals within this species, possibly through transformation. Such a genetic structure makes the population immune to negative long-term consequences of the loss of conventional meiosis 11 , although this does not necessarily imply that interindividual genetic exchanges in A. vaga are directly maintained by natural selection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».