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Enregistrement W2903973548 · doi:10.3390/genes9120639

De Novo Analysis Reveals Transcriptomic Responses in Eriobotrya japonica Fruits during Postharvest Cold Storage

2018· article· en· W2903973548 sur OpenAlex
Shoukai Lin, Ti Wu, Hailan Lin, Yanqing Zhang, Shichang Xu, Jinge Wang, Bisha Wu, Yu Chen, Suying Lin, Dahe Lin, Xiaoxu Zhao, Jincheng Wu

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGenes · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePostharvest Quality and Shelf Life Management
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesPutian UniversityNatural Science Foundation of Fujian ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPostharvestEriobotryaTranscriptomeCold storageBiologyMetabolic pathwaySignal transductionLigninBotanyGeneBiochemistryGene expressionHorticultureJaponica

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cold storage is the primary preservation method of postharvest loquat fruits. However, cold storage also results in many chilling injury physiological disorders called lignification, which decreases the quality and economic value of the fruits. Few studies to date have focused on the transcriptomic responses associated with lignification except lignin synthesis pathways. This study aimed to explore the changes of loquat transcriptome during long-term cold storage. Our results showed that the gene expression patterns were differed among the five stages. The differentially expressed genes (DEGs) in response to cold storage were more intense and complex in earlier stage. The membrane-related genes preferentially responded to low temperature and were followed by intracellular-located genes. The cold-induced pathways were mainly concerned with signal transduction and secondary metabolism (i.e., lignin, pectin, cellulose, terpenoid, carotenoid, steroid) in the first three stages and were chiefly related to primary metabolism in the later two stages, especially energy metabolism. Further investigation suggested that 503 protein kinases, 106 protein phosphatases, and 40 Ca2+ signal components were involved in the cold signal transduction of postharvest loquat fruits. We predicted a pathway including 649 encoding genes of 49 enzymes, which displayed the metabolisms of major sugars and polysaccharides in cold-stored loquat fruits. The coordinated expression patterns of these genes might contribute to the changes of saccharides in the pathway. These results provide new insight into the transcriptomic changes of postharvest loquat fruits in response to cold storage environment, which may be helpful for improving the postharvest life of loquat in the future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,883
Score d'incertitude au seuil0,991

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle