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Enregistrement W2904153289 · doi:10.1111/ppa.12980

Identification of <i>Brassica</i> accessions resistant to ‘old’ and ‘new’ pathotypes of <i>Plasmodiophora brassicae</i> from Canada

2018· article· en· W2904153289 sur OpenAlexafffundabout
Rudolph Fredua‐Agyeman, Sheau‐Fang Hwang, Stephen E. Strelkov, Qixing Zhou, Victor P. Manolii, David Feindel

Notice bibliographique

RevuePlant Pathology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversity of AlbertaAlberta Ministry of Agriculture and ForestryAgriculture Food and Rural Development
Organismes subventionnairesLeibniz-Institut für Pflanzengenetik und KulturpflanzenforschungAlberta Crop Industry Development Fund
Mots-clésClubrootBiologyBrassica rapaBrassicaCanolaBrassica oleraceaSporeBrassicaceaeBotanyHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic resistance is the main tool used to manage clubroot of canola ( Brassica napus ) in Canada. However, the emergence of new virulent strains of the clubroot pathogen, Plasmodiophora brassicae , has complicated canola breeding efforts. In this study, 386 Brassica accessions were screened against five single‐spore isolates (represented by pathotypes 2F, 3H, 5I, 6M and 8N on the Canadian Clubroot Differential Set) and 17 field isolates (represented by 12 unique pathotypes: 2B, 3A, 3D, 3O, 5C, 5G, 5K, 5L, 5X, 8E, 8J and 8P) of P. brassicae to identify resistance sources effective against these strains. The results showed that one B. rapa accession ( CDCNFG ‐046, mean index of disease ( ID ) = 3.3%) and two B. nigra accessions ( CDCNFG ‐263, mean ID = 3.1%; and CDCNFG ‐262, mean ID = 4.7%) possessed excellent resistance to all 22 of the isolates evaluated. Fifty other accessions showed differential clubroot reactions (resistant, moderately resistant or susceptible), including 27 (one B. napus , two B. rapa , four B. oleracea and 20 B. nigra ) accessions that were each resistant to 8–21 P. brassicae isolates, but developed mean ID s in the range of 5.3–29.6%. The remaining 23 accessions (two B. napus , one B . rapa , five B . oleracea and 15 B. nigra ) were each resistant to 3–13 isolates, but developed mean ID s in the range of 30.3–47.0%. The three accessions that showed absolute resistance and the 50 accessions that showed differential clubroot reactions could be used to breed for resistance to the new P. brassicae strains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,628
Score d'incertitude au seuil0,964

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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