PSI-22 Effects of miR156 overexpression and silencing of SPL6 and SPL13 genes on the carbohydrate molecular structures in alfalfa.
Notice bibliographique
Résumé
The objectives of this study were to investigate the effect of overexpression of miR156 (miR156 OE) on carbohydrate molecular structures of alfalfa, in comparison with silencing SPL6 and SPL13 genes (SPL RNAi). Five miR156 OE, three SPL6-silenced (SPL6 RNAi) and three SPL13-silenced (SPL13 RNAi) alfalfa plants were grown with wild type (WT) under greenhouse conditions. Three batches of each genotype were harvested at mid-vegetative stage, freeze-dried and ground through 0.02mm sieve. Spectra were collected with attenuated total reflection Fourier transform infrared spectroscopy (ATR-FTIR). Univariate analysis was performed with OMNIC software and spectral parameters were analyzed with PROC MIXED from SAS 9.4. Hierarchical cluster analysis (HCA) and principle component analysis (PCA) were performed with R software using both original spectra and second derivatives. Results showed that miR156 OE and SPL6/13 RNAi had lower heights and areas of total carbohydrate (TC), cellulosic compounds (CEC) and structural carbohydrate (STC) compared to WT, except that both WT and miR156 OE had higher TC4 and STC4 heights than SPL RNAi. Moreover, miR156 OE had greater STC2 and STC3 heights, and STC area (STCA) compared to SPL6/13 RNAi, and lower CEC height than SPL13 RNAi. As for PCA results, WT could be separated from SPL RNAi in CEC and STC regions with original spectra, and in STC and total carbohydrate (CHO) regions by using second derivatives. In terms of HCA, original spectra clusters distinguished WT from SPL RNAi in TC and STC regions. In contrast, second derivatives clusters could separate WT from both SPL RNAi and miR156 OE in STC and CHO regions. In conclusion, overexpression of miR156 altered the carbohydrate structures of alfalfa, which was similar as silencing of SPL6 and SPL13 genes. The STC region had the most spectral variations in carbohydrate region and could be used for clustering analysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».