323 Paternal effects of peri-pubertal bulls on the transcriptomes of blastocysts.
Notice bibliographique
Résumé
Genetic selection for the best suited offspring’s drives the dairy industry to use young genitors with assisted reproductive technologies (ART) to reduce generation intervals. However, sperms collected from peri-pubertal bulls have lower quality compared to adults. Moreover, new evidences suggest that sperm can transfer not only the paternal genome sequence, but also the epigenetic information including DNA methylation, small non-coding RNAs, retained histones modification, etc. to zygote during fertilization which could interfere with embryogenesis and offspring development. Our previous study identifies differentially methylated regions (DMRs) among sperms from pre-, peri- and post-pubertal bulls. The aim of this study is to investigate the impacts of paternal age on the early embryos by evaluating the transcriptome of bovine blastocysts that are generated by the sperms of bulls at 10, 12 and 16 months of age using IVF with oocytes of adult cows. Whole genome transcriptomic analysis from EmbryoGENE platform show that 17 probes are differentially expressed in both 10 VS 16 months and 12 VS 16 months groups, while 112 probes are exclusively differentially expressed in 10 VS 16 months group, and 130 probes are affected in 12 VS 16 months group (Fold change>1.4, P-value<0.05). Ingenuity Pathway Analysis (IPA) further demonstrates that cellular growth and proliferation, cell death and survival, cellular development are the top 3 bio-functions that are affected by bull age, which are mediated by energy-related pathway, like oxidative phosphorylation, mitochondrial dysfunction and mTOR signaling. Therefore, our preliminary conclusion is that the bull’s age influences the transcriptome of blastocysts mainly on metabolic pathways which could further impact the quality of embryos.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».