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Enregistrement W2904298751 · doi:10.5539/jas.v11n1p11

Kompetitive Allele Specific PCR (KASP): A Singleplex Genotyping Platform and Its Application

2018· article· en· W2904298751 sur OpenAlexvenueno aff
Uzma Majeed, Essam Darwish, Shoaib Ur Rehman, Xueyong Zhang

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of China
Mots-clésGenotypingSNP genotypingVariants of PCRBiologyComputational biologyMolecular Inversion ProbeMultiplexSingle-nucleotide polymorphismSNPGeneticsMultiplex polymerase chain reactionPolymerase chain reactionGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Single nucleotide polymorphism (SNP) can be detected by mining sequence databases or by using different singleplex or multiplex SNP genotyping platforms. Development of high-throughput genotyping molecular markers can be instrumental towards maximizing genetic gain. In this review we provide an overview of Kompetitive Allele Specific PCR (KASP) genotyping platform requirements and its application that might be helpful in KASP marker development. This literature further illustrates the possibilities to design KASP primers. Several research institutes routinely using KASP platform, producing in excess of humungous data points yearly for breeding cultivars and as well as for medical and commercial purposes. KASP genotyping technology offers cost effectiveness and high throughput molecular marker development platform. Conventional molecular markers can be converted into more robust and high throughput KASP markers. More than 2000 published references clearly show the popularity of KASP technology among the researchers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil0,215

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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