MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2904396406 · doi:10.1371/journal.pone.0208974

PR3-ANCA and panel diagnostics in pediatric inflammatory bowel disease to distinguish ulcerative colitis from Crohn's disease

2018· article· en· W2904396406 sur OpenAlexaff
Michael P. Horn, Anna Maria Peter, Franziska Righini‐Grunder, Alexander Leichtle, Johannes Spalinger, Susanne Schibli, Christiane Sokollik

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineUlcerative colitisInflammatory bowel diseaseInternal medicineCohortCrohn's diseaseOdds ratioGastroenterologyPancaVedolizumabDiseaseCohort studyImmunologyAnti-neutrophil cytoplasmic antibodyVasculitis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Accurate classification of patients with inflammatory bowel disease into the subtypes ulcerative colitis (UC) and Crohn's disease (CD) is still a challenge, but important for therapy and prognosis. OBJECTIVES: To evaluate the diagnostic utility of anti-neutrophil cytoplasmic antibodies specific for proteinase-3 (PR3-ANCA) for ulcerative colitis (UC) and the value of an antibody panel incorporating PR3-ANCA to differentiate between Crohn's disease (CD) and UC. STUDY DESIGN: In this cohort study, 122 pediatric and adolescent individuals were retrospectively included (61 IBD patients of two clinical centers, 61 non-IBD controls). All subjects had a comprehensive antibody profile done from stored sera taken close to time of diagnosis. By employing quasi-exhaustive logistic regression the best discriminative model for UC and CD,subjects was determined in a training cohort and confirmed in a validation cohort. RESULTS: PR3-ANCA was specifically associated with UC (odds ratio (OR), 17.6; 95% confidence interval (CI); 3.6, 87); P < .001). A four antibody-panel including PR3-ANCA had an AUC of 90.81% (95%CI; 81.93, 99.69) to distinguish between UC and CD in the training cohort. In a smaller external validation cohort, the AUC was 84.13% (95%CI; 64.21, 100) for accurate diagnosis of CD and UC. CONCLUSION: PR3-ANCA is highly specific for UC. The differentiating capability of a panel, which contains PR3-ANCA and weighs broadly available antibodies, is superior and utilization of the panel can support accurate classification in the work-up of pediatric and adolescent patients with IBD patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetInflammatory Bowel DiseaseTravaux en français237 207