Knockdown of BNIP3L or SQSTM1 alters cellular response to mitochondria target drugs
Notice bibliographique
Résumé
Macroautophagy/autophagy, a pathway by which cellular components are sequestered and degraded in response to homeostatic and cell stress-related signals, is required to preserve hematopoietic stem and progenitor cell function. Loss of chromosomal regions carrying autophagy genes and decreased autophagy gene expression are characteristic of acute myeloid leukemia (AML) cells. Deficiency of autophagy proteins is also linked to an altered AML metabolic profile; altered metabolism has recently emerged as a potential druggable target in AML. Here, we sought to understand the mitochondria-specific changes that occur in leukemia cells after knockdown of BNIP3L/Nix or SQSTM1/p62, which are two autophagy genes involved in mitochondrial clearance and are downregulated in primary AML cells. Mitochondrial function, as measured by changes in endogenous levels of reactive oxygen species (ROS) and mitochondrial membrane potential, was altered in leukemia cells deficient in these autophagy genes. Further, these AML cells were increasingly sensitive to mitochondria-targeting drugs while displaying little change in sensitivity to DNA-targeting agents. These findings suggest that BNIP3L or SQSTM1 may be useful prognostic markers to identify AML patients suitable for mitochondria-targeted therapies. Abbreviations: AML: acute myeloid leukemia; DHE: dihydroethidium; mtDNA: mitochondrial DNA; NAO: 10-N-nonyl acridine orange; PD: population doubling; R123: rhodamine 123; ROS: reactive oxygen species; TRC: transduced scramble controls.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».