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Enregistrement W2904445129 · doi:10.3389/fimmu.2018.02957

Perspective on the Development and Validation of Ab Reagents to Fish Immune Proteins for the Correct Assessment of Immune Function

2018· article· en· W2904445129 sur OpenAlexafffund
Brian Dixon, Daniel R. Barreda, J. Oriol Sunyer

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institute of Food and AgricultureAtlantic Canada Opportunities AgencyCanada Research ChairsU.S. Department of AgricultureNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésImmune systemFish <Actinopterygii>Function (biology)Perspective (graphical)Computational biologyBiologyImmunologyComputer scienceFisheryArtificial intelligenceCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding of immune function in humans and model organisms, such as mice, has advanced in the last few decades because of technological breakthroughs and availability of reagents. While novel genomic technologies have helped to increase knowledge of many aspects of immunology, most developments in immunology have occurred because of the availability of antibodies to identify and sort different cell types, as well as to identify and quantify the protein products of cells. Unfortunately, many studies performed in fish make use of poorly characterized antibody reagents that may affect the conclusions of those studies. In light of this, we would like to offer some insight and discussion points based on our research experience on the strategies and techniques that are required for proper validation of antibody reagents to fish immune molecules. Our main goal is to encourage a much needed discussion in our field to foster the use of correctly validated reagents that enable the study of fish immune function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,036
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,190

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0360,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0030,005
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0060,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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