A study in a Polish ataxia cohort indicates genetic heterogeneity and points to <i>MTCL1</i> as a novel candidate gene
Notice bibliographique
Résumé
Inherited ataxias are a group of highly heterogeneous, complex neurological disorders representing a significant diagnostic challenge in clinical practice. We performed a next-generation sequencing (NGS) analysis in 10 index cases with unexplained progressive cerebellar ataxia of suspected autosomal recessive inheritance. A definite molecular diagnosis was obtained in 5/10 families and included the following diseases: autosomal recessive spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay, POLR3B-related hypomyelinating leukodystrophy, primary coenzyme Q10 deficiency type 4, Niemann-Pick disease type C1 and SYNE1-related ataxia. In addition, we found a novel homozygous MTCL1 loss of function variant p.(Lys407fs) in a 23-year-old patient with slowly progressive cerebellar ataxia, mild intellectual disability, seizures in childhood and episodic pain in the lower limbs. The identified variant is predicted to truncate the protein after first 444 of 1586 amino acids. MTCL1 encodes a microtubule-associated protein highly expressed in cerebellar Purkinje cells; its knockout in a mouse model causes ataxia. We propose MTCL1 as a candidate gene for autosomal recessive cerebellar ataxia in humans. In addition, our study confirms the high diagnostic yield of NGS in early-onset cerebellar ataxias, with at least 50% detection rate in our ataxia cohort.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».