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Enregistrement W2904636673 · doi:10.1093/jas/sky404.292

PSIV-26 Late-Breaking: Evaluation of a genome-based sorting system for feeder cattle.

2018· article· en· W2904636673 sur OpenAlexaff
E. C. Akanno, Chinyere Ekine-Dzivenu, Liuhong Chen, Lisa McKeown, Barry Irving, Lindsey A. Baker, Michael Vinsky, James J. Crowley, M.G. Colazo, D.J. Ambrose, Heather L. Bruce, Mohammed Abo-Ismail, M. D. MacNeil, Graham Plastow, J. A. Basarab, C Li, Carolyn Fitzsimmons

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensAlberta Ministry of Agriculture and ForestryAgriculture and Agri-Food CanadaAgriculture Food and Rural DevelopmentUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMarbled meatBiologyLean meatAnimal science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study evaluated the use of molecular breeding values (MBVs) for carcass traits to sort steers into quality grid and lean meat yield groups. A training set of 2300 animals with genotypes and phenotypes was used to predict MBVs for lean meat yield (LMY) and marbling score (MBS) for 299 Angus, 181 Charolais and 638 Kinsella composite steers using the genomic best linear unbiased prediction method. Steers were placed into MBV-Quality, MBV-Lean, MBV-Marbling and MBV-Other groups on the basis of predicted MBV for LMY and MBS being jointly greater or less than the mean MBV values for both traits. Carcass phenotypes of the steers were then collected and evaluated for consistency with the assigned group using descriptive statistics. Also, the accuracy of genomic predictions was assessed as the additive genetic correlation from a bivariate animal model that fits the observed carcass phenotype and the predicted MBV. The number of steers that met the expected carcass outcome was counted to produce actual percentages for each MBV group. Results showed that on average, MBV-Quality and MBV-Marbling groups had heavier carcasses, greater backfat and more marbling across the three populations while MBV-Lean had leaner carcasses. For most traits, the coefficient of variation suggested less variability and uniform carcass in the MBV-Marbling followed by MBV-Lean and MBV-Quality groups. Greater than 70% of the steers in the MBV-Quality, MBV-Lean and MBV-Marbling groups reached the desired carcass outcome of 70:70 Quality Grid and Y1-lean meat yield in Angus and Charolais but not for Kinsella composite. The accuracy of genomic prediction showed that the MBVs could predict from 60 to 80% of the observed carcass trait values. Thus, genomic profiles can potentially help to streamline the feedlot-finishing process and improve the quality and consistency of beef carcasses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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