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Enregistrement W2904688359 · doi:10.1016/j.pathol.2018.10.014

The role of genetic testing in dyslipidaemia

2018· review· en· W2904688359 sur OpenAlexafffund
Amanda J. Berberich, Robert A. Hegele

Notice bibliographique

RevuePathology · 2018
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipid metabolism and disorders
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesSchulich School of Medicine and DentistryCanadian Institutes of Health ResearchSchulich School of Medicine and Dentistry, Western UniversityWestern UniversityNorthwestern UniversityHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésGenetic testingMedicineGenotypingGenetic diagnosisDiseaseGenetic counselingBioinformaticsIntensive care medicineGeneticsBiologyPathologyGenotypeInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dyslipidaemias encompass about two dozen relatively rare monogenic disorders and syndromes for which the genetic basis has largely been defined. In addition, the complex polygenic basis of disturbed lipids and lipoproteins has been characterised in many patients, and has been shown to result from accumulation of many common polymorphisms with small effects on lipids. Genetic technologies, including dedicated genotyping and sequencing methods can detect both rare and common DNA variants underlying dyslipidaemias. Some dyslipidaemias may be clinically silent for years, but early diagnosis, including genetic diagnosis, may permit early intervention to prevent or delay deleterious downstream clinical consequences, such as premature vascular disease or acute pancreatitis. The potential clinical utility of genetic testing for familial hypercholesterolaemia, familial chylomicronaemia syndrome, lysosomal acid lipase deficiency and some others will increase demand for reliable genetic diagnostic methods. We review some current technologies, such as targeted next-generation sequencing that seem to be helpful with DNA diagnosis of dyslipidaemias. We also address technical, biological and clinical limitations of genetic testing in dyslipidaemias. Finally, genetic counselling issues, the potential impact of results on patients and health care providers, current gaps and future directions will be discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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