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Enregistrement W2904745314 · doi:10.1111/jbi.13488

The International Tree‐Ring Data Bank (<scp>ITRDB</scp>) revisited: Data availability and global ecological representativity

2018· article· en· W2904745314 sur OpenAlexaff
Shoudong Zhao, Neil Pederson, Loïc D’Orangeville, Janneke HilleRisLambers, Emery R. Boose, Caterina Penone, B. A. Bauer, Yuan Jiang, Rubén D. Manzanedo

Notice bibliographique

RevueJournal of Biogeography · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueTree-ring climate responses
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesChina Scholarship CouncilNational Natural Science Foundation of ChinaSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésGeographyAridDiversity (politics)EcologyTree (set theory)Environmental resource managementEnvironmental scienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aim The International Tree‐Ring Data Bank ( ITRDB ) is the most comprehensive database of tree growth. To evaluate its usefulness and improve its accessibility to the broad scientific community, we aimed to: (a) quantify its biases, (b) assess how well it represents global forests, (c) develop tools to identify priority areas to improve its representativity, and d) make available the corrected database. Location Worldwide. Time period Contributed datasets between 1974 and 2017. Major taxa studied Trees. Methods We identified and corrected formatting issues in all individual datasets of the ITRDB . We then calculated the representativity of the ITRDB with respect to species, spatial coverage, climatic regions, elevations, need for data update, climatic limitations on growth, vascular plant diversity, and associated animal diversity. We combined these metrics into a global Priority Sampling Index ( PSI ) to highlight ways to improve ITRDB representativity. Results Our refined dataset provides access to a network of >52 million growth data points worldwide. We found, however, that the database is dominated by trees from forests with low diversity, in semi‐arid climates, coniferous species, and in western North America. Conifers represented 81% of the ITRDB and even in well‐sampled areas, broadleaves were poorly represented. Our PSI stressed the need to increase the database diversity in terms of broadleaf species and identified poorly represented regions that require scientific attention. Great gains will be made by increasing research and data sharing in African, Asian, and South American forests. Main conclusions The extensive data and coverage of the ITRDB show great promise to address macroecological questions. To achieve this, however, we have to overcome the significant gaps in the representativity of the ITRDB . A strategic and organized group effort is required, and we hope the tools and data provided here can guide the efforts to improve this invaluable database.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,021
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,075
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,109

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0210,075
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0070,018
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations193
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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