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Enregistrement W2904785470 · doi:10.1093/femsle/fny285

Decoding the ocean's microbiological secrets for marine enzyme biodiscovery

2018· review· en· W2904785470 sur OpenAlexaff
Manuel Ferrer, Celia Méndez–García, Rafael Bargiela, Jennifer Chow, Sandra Alonso, Antonio García‐Moyano, Gro Elin Kjæreng Bjerga, Ida Helene Steen, Tatjana M.E. Schwabe, Charlotte Blom, Jan Kjølhede Vester, Andrea Weckbecker, Patrick Shahgaldian, Carla C. C. R. de Carvalho, Rolandas Meškys, Giulio Zanaroli, Frank Oliver Glöckner, Antonio Fernàndez-Guerra, Siva Thambisetty, Fernando de la Calle, Olga V. Golyshina, Michail M. Yakimov, Karl‐Erich Jaeger, Alexander F. Yakunin, Oonagh McMeel, Jan-Bart Calewaert, Nathalie Tonné, Peter N. Golyshin

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Letters · 2018
Typereview
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMinisterio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de EspañaFundação para a Ciência e a TecnologiaERAB: The European Foundation for Alcohol ResearchEuropean CommissionMinisterio de Ciencia, Innovación y Universidades
Mots-clésAbundance (ecology)SeawaterEcologyPopulationMicrobial population biologyBiologyMarine lifeMicrobial ecologyOceanographyBiodiversityMarine bacteriophageEnvironmental scienceBacteriaGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A global census of marine microbial life has been underway over the past several decades. During this period, there have been scientific breakthroughs in estimating microbial diversity and understanding microbial functioning and ecology. It is estimated that the ocean, covering 71% of the earth's surface with its estimated volume of about 2 × 1018 m3 and an average depth of 3800 m, hosts the largest population of microbes on Earth. More than 2 million eukaryotic and prokaryotic species are thought to thrive both in the ocean and on its surface. Prokaryotic cell abundances can reach densities of up to 1012 cells per millilitre, exceeding eukaryotic densities of around 106 cells per millilitre of seawater. Besides their large numbers and abundance, marine microbial assemblages and their organic catalysts (enzymes) have a largely underestimated value for their use in the development of industrial products and processes. In this perspective article, we identified critical gaps in knowledge and technology to fast-track this development. We provided a general overview of the presumptive microbial assemblages in oceans, and an estimation of what is known and the enzymes that have been currently retrieved. We also discussed recent advances made in this area by the collaborative European Horizon 2020 project 'INMARE'.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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