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Enregistrement W2904785785 · doi:10.11575/prism/34978

Characterizing the Role of the Type VI Secretion System in Interbacterial Species Interactions and Pathogenesis

2018· dissertation· en· W2904785785 sur OpenAlexfundno aff
Megan J. Q. Wong

Notice bibliographique

RevueOpen MIND · 2018
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCumming School of Medicine, University of CalgaryAlberta InnovatesAlberta Innovates - Health SolutionsNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCystic Fibrosis CanadaAlberta Livestock and Meat AgencyCanada Research ChairsGovernment of Canada
Mots-clésSecretionPathogenesisBiologyBiochemistryImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacteria require molecular mechanisms to properly sense and respond to their environment. This allows them to compete for specific niches, persist in polymicrobial communities, and contribute to virulence and pathogenesis. One mechanism Gram-negative bacteria have adapted is the use of type VI secretion systems (T6SS). The T6SS is a large needle complex that spans across the entire bacterial cell wall and functions through a contraction mechanism that results in the delivery of toxic effector proteins into neighbouring cells. Virulence is achieved through the targeting of essential components found in either eukaryotic or prokaryotic organisms, including cell wall, membrane lipids, and DNA. Despite the importance of the T6SS as an interbacterial weapon, there still exists an incomplete understanding of how T6SS expressing species can co-exist and the implications of antagonistic responses in shaping polymicrobial communities. Further, these species are often subject to a changing environment and yet, the role of environmental signals and their influence on interspecies interactions and the expression of the T6SS, remain largely unknown. Here, I examined the role of the T6SS in the context of multispecies communities. Using a mix of two antagonistic T6SS strains, Vibrio cholerae V52 and Aeromonas hydrophila SSU, both species co-existed despite active bacterial killing. Fluorescence microscopy analyses revealed survival was possible through the formation of sister-cell clusters. Cluster formation was dependent on T6SS effector delivery, highlighting a unique mechanism where destructive responses can mediate protection within a community. I also examined the environmental signals that activate the T6SS using Pseudomonas aeruginosa PAO1, a strain with a tightly regulated T6SS, as a model system. Results reveal that extracellular DNA, prevalent in cystic fibrosis sputum, activates the H1-T6SS cluster of P. aeruginosa. The addition of excess magnesium ions in the media negates the effect of eDNA on T6SS activation, suggesting eDNA may be a chelator of membrane ions and T6SS activation is a consequence of a perturbed membrane. Overall, I provide new insight into how bacterial communities are shaped, and the type of adaptations bacteria undergo to better survive and compete in the environment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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