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Enregistrement W2904934103 · doi:10.1093/jas/sky404.086

PSXIV-13 Novel DI/LC-MS/MS-based urinary metabolite signatures for monitoring dairy cows for occurrence of retained placenta.

2018· article· en· W2904934103 sur OpenAlexaff
Elda Dervishi, Guanshi Zhang, David S. Wishart, Burim N. Ametaj

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueReproductive Physiology in Livestock
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetaboliteUrineUrinary systemChemistryMetabolomeEndocrinologyInternal medicineAnimal sciencePlacentaMedicinePregnancyBiologyFetus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this study was to determine presence of alterations in the urinary metabolite signatures related to amino acids (AAs), acylcarnitines (ACs), biogenic amines (BAs), glycerophospholipids, sphingolipids (SM) and hexose metabolism in cows that expelled fetal membranes normally and those with retained placenta (RP). Six cows that were diagnosed with RP and 20 healthy control cows (CON), similar in parity and body condition score were selected. Urine samples were collected at -8 and -4 wks prior to parturition, the week of RP as well as at +4 and +8 wks postpartum in Holstein dairy cows. AbsoluteIDQ 180 kit (BIOCRATES, Austria) was used to determine urinary metabolite signatures in RP and CON cows. Univariate analysis was performed using R (version 3.0.3; 2008). Metabolomic data were analyzed by MetaboAnalyst. Statistical significance was declared at P < 0.05. At -8 and -4 wks prepartum and the week of RP diagnosis, the urine of cows with RP was characterized by higher concentrations of 19 species of ACs, aspartate, asymmetric dimethylarginine (SDMA) and carnosine (PPPP<0.05). In conclusion, pre-RP and RP cows were characterized by higher excretion of ACs, ADMA, aspartate, and carnosine in the urine. Moreover, RP was preceded by lower concentrations of multiple species of phosphatidylcholines in the urine starting from -8 wks prior to parturition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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