PSXIV-13 Novel DI/LC-MS/MS-based urinary metabolite signatures for monitoring dairy cows for occurrence of retained placenta.
Notice bibliographique
Résumé
The objective of this study was to determine presence of alterations in the urinary metabolite signatures related to amino acids (AAs), acylcarnitines (ACs), biogenic amines (BAs), glycerophospholipids, sphingolipids (SM) and hexose metabolism in cows that expelled fetal membranes normally and those with retained placenta (RP). Six cows that were diagnosed with RP and 20 healthy control cows (CON), similar in parity and body condition score were selected. Urine samples were collected at -8 and -4 wks prior to parturition, the week of RP as well as at +4 and +8 wks postpartum in Holstein dairy cows. AbsoluteIDQ 180 kit (BIOCRATES, Austria) was used to determine urinary metabolite signatures in RP and CON cows. Univariate analysis was performed using R (version 3.0.3; 2008). Metabolomic data were analyzed by MetaboAnalyst. Statistical significance was declared at P < 0.05. At -8 and -4 wks prepartum and the week of RP diagnosis, the urine of cows with RP was characterized by higher concentrations of 19 species of ACs, aspartate, asymmetric dimethylarginine (SDMA) and carnosine (PPPP<0.05). In conclusion, pre-RP and RP cows were characterized by higher excretion of ACs, ADMA, aspartate, and carnosine in the urine. Moreover, RP was preceded by lower concentrations of multiple species of phosphatidylcholines in the urine starting from -8 wks prior to parturition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».