The Composition of Midgut Bacteria in<i>Aedes aegypti</i>(Diptera: Culicidae) That Are Naturally Susceptible or Refractory to Dengue Viruses
Notice bibliographique
Résumé
The composition, abundance, and diversity of midgut bacteria in mosquitoes can influence pathogen transmission. We used 16S rRNA microbiome profiling to survey midgut microbial diversity in pooled samples of laboratory colonized dengue-refractory, Cali-MIB, and dengue-susceptible, Cali-S Aedes aegypti (Linnaeus). The 16S rRNA sequences from the sugar-fed midguts of adult females clustered to 63 amplicon sequence variants (ASVs), primarily from Proteobacteria, Firmicutes, Flavobacteria, and Actinobacteria. An average of five ASVs dominated the midguts, and most ASVs were present in both Cali-MIB and Cali-S midguts. No differences in abundance were noted at any phylogenetic level (Phylum, Class, Order, Family, Genus) by analysis of composition of microbiome (w = 0). No community diversity metrics were significantly different between refractory and susceptible mosquitoes. These data suggest that phenotypic differences in the susceptibility to dengue virus between Cali-MIB and Cali-S are not likely due to major differences in midgut bacterial communities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».