The structure of mammalian β‐mannosidase provides insight into β‐mannosidosis and nystagmus
Notice bibliographique
Résumé
β-Mannosidase is a lysosomal enzyme from the glycosyl hydrolase family 2 that cleaves the single β(1-4)-linked mannose at the nonreducing end of N-glycosylated proteins, and plays an important role in the polysaccharide degradation pathway. Mutations in the MANBA gene, which encodes the β-mannosidase, can lead to the lysosomal storage disease β-mannosidosis, as well as nystagmus, an eye condition characterized by involuntary eye movements. Here, we present the first structures of a mammalian β-mannosidase in both the apo- and mannose-bound forms. The structure is similar to previously determined β-mannosidase structures with regard to domain organization and fold, however, there are important differences that underlie substrate specificity between species. Additionally, in contrast to most other ligand-bound β-mannosidases from bacterial and fungal sources where bound sugars were in a boat-like conformation, we find the mannose in the chair conformation. Evaluation of known disease mutations in the MANBA gene provides insight into their impact on disease phenotypes. Together, these results will be important for the design of therapeutics for treating diseases caused by β-mannosidase deficiency. DATABASE: Structural data are available in the Protein Data Bank under the accession numbers 6DDT and 6DDU.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».