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Enregistrement W2905009893 · doi:10.1242/jeb.194787

Nitrogen handling in the elasmobranch gut: a role for microbial urease

2018· article· en· W2905009893 sur OpenAlexafffund
Chris M. Wood, Hon Jung Liew, Gudrun De Boeck, J. Lisa Hoogenboom, W. Gary Anderson

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of ManitobaMcMaster UniversityBamfield Marine Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversiti Malaysia TerengganuNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcMaster UniversityMinistry of Higher Education, MalaysiaCanada Research ChairsInternational Development Research CentreUniversiteit Antwerpen
Mots-clésUreaseNitrogenNitrogen cycleEnvironmental chemistryChemistryBiologyEcologyMicrobiologyBiochemistryEnzymeOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ureotelic elasmobranchs require nitrogen for both protein growth and urea-based osmoregulation, and therefore are probably nitrogen-limited in nature. Mechanisms exist for retaining and/or scavenging nitrogen at gills, kidney, rectal gland, and gut, but as yet, the latter are not well characterized. Intestinal sac preparations of the Pacific spiny dogfish shark (Squalus acanthias suckleyi) incubated in vitro strongly reabsorbed urea from the lumen after feeding, but mucosal fluid ammonia concentrations increased with incubation time. Phloretin (0.25 mmol L−1, which blocked urea reabsorption) greatly increased the rate of ammonia accumulation in the lumen. A sensitive [14C]urea-based assay was developed to examine the potential role of microbial urease in this ammonia production. Urease activity was detected in chyme/intestinal fluid and intestinal epithelial tissue of both fed and fasted sharks. Urease was not present in gall-bladder bile. Urease activities were highly variable among animals, but generally greater in chyme than in epithelia, and greater in fed than in fasted sharks. Comparable urease activities were found in chyme and epithelia of the Pacific spotted ratfish (Hydrolagus colliei), a ureotelic holocephalan, but were much lower in ammonotelic teleosts. Urease activity in dogfish chyme was inhibited by acetohydroxamic acid (1 mmol L−1) and by boiling. Treatment of dogfish gut sac preparations with acetohydroxamic acid blocked ammonia production, changing net ammonia accumulation into net ammonia absorption. We propose that microbial urease plays an important role in nitrogen handling in the elasmobranch intestine, allowing some urea-N to be converted to ammonia and then reabsorbed for amino acid synthesis or reconversion to urea.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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