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Enregistrement W2905035821 · doi:10.1016/j.nicl.2018.101645

Automated classification of Alzheimer's disease and mild cognitive impairment using a single MRI and deep neural networks

2018· article· en· W2905035821 sur OpenAlexfundno aff
Silvia Basaia, Federica Agosta, Luca Wagner, Elisa Canu, Giuseppe Magnani, Roberto Santangelo, Massimo Filippi

Notice bibliographique

RevueNeuroImage Clinical · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean Research CouncilNational Institutes of HealthAgenzia di Ricerca per la Sclerosi Laterale AmiotroficaMinistry of Health, British ColumbiaAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNational Institute on AgingEli Lilly and CompanyNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringF. Hoffmann-La RocheU.S. Department of Defense
Mots-clésCognitive impairmentNeuroimagingConvolutional neural networkArtificial intelligenceAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeDeep learningCognitionMri scanMagnetic resonance imagingComputer sciencePsychologyPattern recognition (psychology)MedicineNeuroscienceRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We built and validated a deep learning algorithm predicting the individual diagnosis of Alzheimer's disease (AD) and mild cognitive impairment who will convert to AD (c-MCI) based on a single cross-sectional brain structural MRI scan. Convolutional neural networks (CNNs) were applied on 3D T1-weighted images from ADNI and subjects recruited at our Institute (407 healthy controls [HC], 418 AD, 280 c-MCI, 533 stable MCI [s-MCI]). CNN performance was tested in distinguishing AD, c-MCI and s-MCI. High levels of accuracy were achieved in all the classifications, with the highest rates achieved in the AD vs HC classification tests using both the ADNI dataset only (99%) and the combined ADNI + non-ADNI dataset (98%). CNNs discriminated c-MCI from s-MCI patients with an accuracy up to 75% and no difference between ADNI and non-ADNI images. CNNs provide a powerful tool for the automatic individual patient diagnosis along the AD continuum. Our method performed well without any prior feature engineering and regardless the variability of imaging protocols and scanners, demonstrating that it is exploitable by not-trained operators and likely to be generalizable to unseen patient data. CNNs may accelerate the adoption of structural MRI in routine practice to help assessment and management of patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,111
Tête enseignante GPT0,421
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations720
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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