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Enregistrement W2905224024 · doi:10.1186/s12870-018-1570-4

Cloning and characterization of norbelladine synthase catalyzing the first committed reaction in Amaryllidaceae alkaloid biosynthesis

2018· article· en· W2905224024 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueChemical synthesis and alkaloids
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyBiosynthesisCloning (programming)AmaryllidaceaeAlkaloidATP synthaseBiochemistryAmaryllidaceae AlkaloidsEnzymeComputational biologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Amaryllidaceae alkaloids (AAs) are a large group of plant-specialized metabolites displaying an array of biological and pharmacological properties. Previous investigations on AA biosynthesis have revealed that all AAs share a common precursor, norbelladine, presumably synthesized by an enzyme catalyzing a Mannich reaction involving the condensation of tyramine and 3,4-dihydroxybenzaldehyde. Similar reactions have been reported. Specifically, norcoclaurine synthase (NCS) which catalyzes the condensation of dopamine and 4-hydroxyphenylacetaldehyde as the first step in benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis. RESULTS: With the availability of wild daffodil (Narcissus pseudonarcissus) database, a transcriptome-mining search was performed for NCS orthologs. A candidate gene sequence was identified and named norbelladine synthase (NBS). NpNBS encodes for a small protein of 19 kDa with an anticipated pI of 5.5. Phylogenetic analysis showed that NpNBS belongs to a unique clade of PR10/Bet v1 proteins and shared 41% amino acid identity to opium poppy NCS1. Expression of NpNBS cDNA in Escherichia coli produced a recombinant enzyme able to condense tyramine and 3,4-DHBA into norbelladine as determined by high-resolution tandem mass spectrometry. CONCLUSIONS: Here, we describe a novel enzyme catalyzing the first committed step of AA biosynthesis, which will facilitate the establishment of metabolic engineering and synthetic biology platforms for the production of AAs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil0,403

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle