PSXII-23 iTRAQ-based proteomic analysis reveals key proteins affecting feed efficiency in Holstein heifers limit-fed with low or high concentrate diets.
Notice bibliographique
Résumé
Limit-feeding high concentrate diets was proposed as an effective method to improve feed efficiency in heifers’ raising, while the physiological mechanism behind was still unclear. The objective of this study was to evaluate the effects of limit-feeding different levels of concentrate diets on liver proteomics by iTRAQ in Holstein heifers. Twelve half-sib Holstein heifers (8 to 10 months and 253 ± 29 kg of BW) were assigned into two groups and fed diets containing different levels of concentrate (20% and 80%, namely C20 and C80, respectively) for 28 days. The quantity of diets provided to high concentrate groups was restricted so that there was a similar intake of metabolizable energy to low concentrate fed groups. At the end of experiment, liver biopsies were obtained and iTRAQ-8Plex were performed. Data were analyzed using the PROC MIXED procedure of SAS. The C80 group had higher (P < 0.01) feed efficiency (average daily gain/dry matter intake) than C20 group. In total, 25,633 peptides corresponding to 3,499 proteins were detected from liver proteomic analysis. Comparison of expression patterns between C20 and C80 revealed 60 differentially expressed proteins (DEPs) (fold change > 1.2; P < 0.05), of which 28 were up-regulated and 32 were down-regulated in the C20 group. Functional annotation suggested that three DEPs (GOT2, GLUD1, PSPH) involved in amino acid metabolism, four DEPs (ECHS1, UGT1A6, UGDH, ALDOB) involved in carbohydrate metabolism, six DEPs (ACOX1, ACSS3, ACAT1, HMGCS2, CYP2E1, CYP1A1) involved in lipid metabolism, and three DEPs (EPHX1, GSTP1, CBR1) involved in cell redox homeostasis were related to the energy metabolism in our study. Nine DEPs were analysed using parallel reaction monitoring to confirm the reliability of the iTRAQ analysis. Our results demonstrated that amino acids, carbohydrate, and lipid metabolism and oxidative reduction pathways in the liver were all involved energy utilization in high or low concentrate limit-fed heifers. Key Words:
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».