238 Transcriptome profiling of primary bovine macrophages from cows with Johne’s disease suggests a tolerance state induced by convergent signalling via NF-κB and its synergistic tolerized genes.
Notice bibliographique
Résumé
Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis (MAP) causes Johne’s disease (JD) in ruminants. The mechanisms of JD pathogenesis are still unclear, but it is known that this obligatory bacterium manipulates macrophages for its survival and long-term infection success in its host. A comparative transcriptomic analysis (next-generation RNA sequencing) was performed to study the global transcriptional shift mechanism observed in macrophages from JD-positive (+) cows (serum-ELISA positive for MAP antigens and excreting live MAP in their feces). Six JD-negative (−) cows and six JD(+) cows were selected. Monocyte-derived macrophages (MDM) were infected ex vivo for 1, 4, 8, and 24 h with live MAP at a multiplicity of infection of 10:1. While MAP-infected macrophages from JD(−) cows showed a robust pro-inflammatory induction of 3,765 genes (p < 0. 05) during the first 1 to 8 h (TNF, NF-κB, and cytokine members), only 31 genes were differentially expressed for JD(+). The top upregulated genes subsequently (24 h) shifted toward an anti-inflammatory and pro-resolution state. This distinct tolerization signature was confirmed in JD(+) macrophages during a subsequent exposure to MAP. Validation of key tolerized genes showed that JD(+) macrophages were shaped to not respond to subsequent transcriptional and immune MAP stimuli. For instance, while a synergistic activation of NF-κB, MAPK, and IRF pathways were associated with acute cytokine responses in JD(−), the canonical NF-κB pathway (p50/p65/BCL3) and the sequestosome were tightly regulated in JD(+) macrophages. Understanding the precise mechanism of the distinct transcriptional stimulation observed in JD(+) macrophages is paramount for eventual development of a treatment or even treatments. Our findings support the hypothesis that MAP could induce a tolerant state in the circulating monocytes of JD(+) cows, thus preventing response to a subsequent MAP exposure. This report provides important clues about MAP survival mechanisms and how MAP manipulates macrophages to promote disease persistence in dairy cattle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».