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Enregistrement W2905497396 · doi:10.1038/s41467-018-07806-6

Interleukin 2 modulates thymic-derived regulatory T cell epigenetic landscape

2018· article· en· W2905497396 sur OpenAlexafffund
Laurent Chorro, Masako Suzuki, Shu Shien Chin, Tere Williams, Erik L. Snapp, Livia Odagiu, Nathalie Labrecque, Grégoire Lauvau

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchAlbert Einstein College of Medicine, Yeshiva UniversityNational Institutes of Health
Mots-clésFOXP3BiologyT cellT-cell receptorCell biologyChromatinEpigeneticsTranscription factorIL-2 receptorRegulatory T cellImmune systemImmunologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Foxp3+CD4+ regulatory T (Treg) cells are essential for preventing fatal autoimmunity and safeguard immune homeostasis in vivo. While expression of the transcription factor Foxp3 and IL-2 signals are both required for the development and function of Treg cells, the commitment to the Treg cell lineage occurs during thymic selection upon T cell receptor (TCR) triggering, and precedes the expression of Foxp3. Whether signals beside TCR contribute to establish Treg cell epigenetic and functional identity is still unknown. Here, using a mouse model with reduced IL-2 signaling, we show that IL-2 regulates the positioning of the pioneer factor SATB1 in CD4+ thymocytes and controls genome wide chromatin accessibility of thymic-derived Treg cells. We also show that Treg cells receiving only low IL-2 signals can suppress endogenous but not WT autoreactive T cell responses in vitro and in vivo. Our findings have broad implications for potential therapeutic strategies to reprogram Treg cells in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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