MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2905612416 · doi:10.1111/mec.14993

Plumage microbiota covaries with the major histocompatibility complex in blue petrels

2018· article· en· W2905612416 sur OpenAlexfundno aff
Sarah Leclaire, Maria Strandh, Gaia Dell’Ariccia, Marianne Gabirot, Helena Westerdahl, Francesco Bonadonna

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Behavior and Reproduction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitut Polaire Français Paul Emile VictorAgence Nationale de la RecherchePolar Knowledge Canada
Mots-clésBiologyMajor histocompatibility complexPlumageFeatherMHC class IEvolutionary biologyZoologyGeneticsEcologyImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To increase fitness, a wide range of vertebrates preferentially mate with partners that are dissimilar at the major histocompatibility complex (MHC) or that have high MHC diversity. Although MHC often can be assessed through olfactory cues, the mechanism by which MHC genes influence odour remains largely unclear. MHC class IIB molecules, which enable recognition and elimination of extracellular bacteria, have been suggested to influence odour indirectly by shaping odour-producing microbiota, i.e. bacterial communities. However, there is little evidence of the predicted covariation between an animal's MHC genotype and its bacterial communities in scent-producing body surfaces. Here, using high-throughput sequencing, we tested the covariation between MHC class IIB genotypes and feather microbiota in the blue petrel (Halobaena caerulea), a seabird with highly developed olfaction that has been suggested to rely on oduor cues during an MHC-based mate choice. First, we show that individuals with similar MHC class IIB profiles also have similar bacterial assemblages in their feathers. Then, we show that individuals with high MHC diversity have less diverse feather microbiota and also a reduced abundance of a bacterium of the genus Arsenophonus, a genus in which some species are symbionts of avian ectoparasites. Our results, showing that feather microbiota covary with MHC, are consistent with the hypothesis that individual MHC genotype may shape the semiochemical-producing microbiota in birds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,932
Score d'incertitude au seuil0,683

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular EcologyMême sujetAnimal Behavior and ReproductionTravaux en français237 207