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Enregistrement W2905722121 · doi:10.25073/2588-1140/vnunst.4796

Study on the Association of some Single Nucleotide Polymorphisms of CYP19A1 Gene with Breast Cancer in Vietnamese Women

2018· article· en· W2905722121 sur OpenAlexaboutno aff
Huyen T. M. Pham, Tran Thi Thuy Anh, Nguyễn Thị Hồng Vân

Notice bibliographique

RevueVNU Journal of Science Natural Sciences and Technology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSNPGenotypeBreast cancerSingle-nucleotide polymorphismAromataseBiologyGeneticsInternal medicineGeneEndocrinologyCancerOncologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The CYP19A1 gene encodes for aromatase P450, which is a key enzyme in estrogen metabolism, catalyzes the conversation of testosterone to estradiol and androstenedione to estrone. It is generally believed that polymorphisms in genes coding for key enzymes involved in these pathways could effect to the activity of enzymes, which can change the level of endogenous hormones. Therefore genetic polymorphisms in hormone-related genes could increase the breast cancer susceptibility. In this study, 60 blood samples of breast cancer women and 50 control populations were analyzed to identify the genotype frequency at SNP loci rs10046 C>T and rs2236722 Trp39Arg (T>C) on CYP19A1 using PCR-RFLP and PCR-CTPP respectively. The data were analyzed to determine the association between these polymorphism loci and susceptibility to breast cancer. The result showed that, the genotype frequencies at SNP rs10046 in the control as: CC (14%), CT (48%), TT (38%), in case group are CC (18.33%) , CT (58.33%) and TT (23.34%); at SNP rs2236722 in the control group: TT (94%), TC (6%), in case group TT (90%), TC (10%). The OR analyses for the gene carrying the CC and TC genotypes compared with TT genotype at both loci (OR=2.01; 95% CI=0.87–4.67 with rs10046 and OR = 1.74; 95% CI= 0.40 – 7.42 with rs2236722) indicated that these SNP loci in CYP19A1 have no effect on breast cancer susceptibility.
 Keywords
 Breast cancer, SNP, rs10046, rs2236722, CYP19A1 gene
 References
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Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,831

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

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Publié2018
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