Safe Harbor Targeted CRISPR-Cas9 Tools for Molecular-Genetic Imaging of Cells in Living Subjects
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Noninvasive molecular-genetic imaging of cells expressing imaging reporter genes is an invaluable approach for longitudinal monitoring of the biodistribution and viability of cancer cells and cell-based therapies in preclinical models and patients. However, labeling cells with reporter genes often relies on using gene transfer methods that randomly integrate the reporter genes into the genome, which may cause unwanted and serious detrimental effects. To overcome this, we have developed CRISPR-Cas9 tools to edit cells at the adeno-associated virus site 1 (AAVS1) safe harbour with a large donor construct (∼6.3 kilobases) encoding an antibiotic resistance gene and reporter genes for bioluminescence (BLI) and fluorescence imaging. HEK293T cells were transfected with a dual plasmid system encoding the Cas9 endonuclease and an AAVS1-targeted guide RNA in one plasmid, and a donor plasmid encoding a puromycin resistance gene, tdTomato and firefly luciferase flanked by AAVS1 homology arms. Puromycin-resistant clonal cells were isolated and AAVS1 integration was confirmed via PCR and sequencing of the PCR product. In vitro BLI signal correlated well to cell number ( R 2 = 0.9988; p < 0.05) and was stable over multiple passages. Engineered cells (2.5 × 10 6 ) were injected into the left hind flank of nude mice and in vivo BLI was performed on days 0, 7, 14, 21, and 28. BLI signal trended down from day 0 to day 7, but significantly increased by day 28 due to cell growth ( p < 0.05). This describes the first CRISPR-Cas9 system for AAVS1 integration of large gene constructs for molecular-genetic imaging of cells in vivo . With further development, including improving editing efficiency, use of clinically relevant reporters, and evaluation in other cell populations that can be readily expanded in culture (e.g., immortalized cells or T cells), this CRISPR-Cas9 reporter gene system could be broadly applied to a number of in vivo cell tracking studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».