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Enregistrement W2906076582 · doi:10.1089/crispr.2018.0030

Safe Harbor Targeted CRISPR-Cas9 Tools for Molecular-Genetic Imaging of Cells in Living Subjects

2018· article· en· W2906076582 sur OpenAlex
Veronica P. Dubois, Darya Zotova, Katie M. Parkins, Connor Swick, Amanda M. Hamilton, John J. Kelly, John A. Ronald

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe CRISPR Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensLawson Health Research InstituteRobarts Clinical TrialsWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCRISPRCas9BiologyReporter genePlasmidGeneGenome editingGreen fluorescent proteinMolecular biologyGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Noninvasive molecular-genetic imaging of cells expressing imaging reporter genes is an invaluable approach for longitudinal monitoring of the biodistribution and viability of cancer cells and cell-based therapies in preclinical models and patients. However, labeling cells with reporter genes often relies on using gene transfer methods that randomly integrate the reporter genes into the genome, which may cause unwanted and serious detrimental effects. To overcome this, we have developed CRISPR-Cas9 tools to edit cells at the adeno-associated virus site 1 (AAVS1) safe harbour with a large donor construct (∼6.3 kilobases) encoding an antibiotic resistance gene and reporter genes for bioluminescence (BLI) and fluorescence imaging. HEK293T cells were transfected with a dual plasmid system encoding the Cas9 endonuclease and an AAVS1-targeted guide RNA in one plasmid, and a donor plasmid encoding a puromycin resistance gene, tdTomato and firefly luciferase flanked by AAVS1 homology arms. Puromycin-resistant clonal cells were isolated and AAVS1 integration was confirmed via PCR and sequencing of the PCR product. In vitro BLI signal correlated well to cell number ( R 2 = 0.9988; p < 0.05) and was stable over multiple passages. Engineered cells (2.5 × 10 6 ) were injected into the left hind flank of nude mice and in vivo BLI was performed on days 0, 7, 14, 21, and 28. BLI signal trended down from day 0 to day 7, but significantly increased by day 28 due to cell growth ( p < 0.05). This describes the first CRISPR-Cas9 system for AAVS1 integration of large gene constructs for molecular-genetic imaging of cells in vivo . With further development, including improving editing efficiency, use of clinically relevant reporters, and evaluation in other cell populations that can be readily expanded in culture (e.g., immortalized cells or T cells), this CRISPR-Cas9 reporter gene system could be broadly applied to a number of in vivo cell tracking studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,178
Score d'incertitude au seuil0,673

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle